Есть проблемка.

Плагин работает корректно до момента, когда между двумя точками (жёлтыми) образуется равнозначное расстояние. То есть, он летит от первого желтого флага в правильном направлении, получает там точно такой же жёлтый флаг (потому что летит дальше, чем нужно) и образует цикличность. Можно как-то поменять самому в конфиге шаг отступа?

Так как можно исправить данную проблему?

Нет, пользователю настройка данного функционала недоступна.